microRNA는 어떤 과정을 거쳐 만들어지는가? 그리고 어떻게 조절되는가? 암세포와 줄기세포에서 이 작은 RNA들은 어떤 역할을 하는가? – 이 질문들은 저희 연구실의 주요 연구 주제이자 RNA 분야의 핵심적인 질문들입니다.
 
microRNA는 22 nt 길이의 작은 RNA입니다. Messenger RNA에 결합해 단백질 합성을 조절함으로써, 발생, 세포분화, 세포사멸, 세포분열, 암 발생 과정 등에서 다양하고도 핵심적인 역할을 합니다. 따라서 microRNA의 결함으로 인해 발생하는 질병의 연구나 microRNA를 활용한 유전자 조절 기술은 향후 신약개발을 위한 기반을 제공할 것입니다.
 
저희 연구실은 microRNA의 transcription, splicing, processing에 있어 선도적인 연구를 하고 있으며, microRNA에 관한 새로운 연구방법을 개발함으로써 RNA 분야의 발전에 기여하고 있습니다. 그 외에도 세포분자생물학, 유전학, 생물정보학, 생물리학을 활용한 다양한 접근방법으로 microRNA의 생성과 기능을 밝히고 있습니다.
 
저희 연구실에서는 RNA world의 큰 가능성에 도전할 새로운 식구들을 찾습니다. 특히 초파리 유전학 또는 생물정보학을 전공한 포스트닥을 초빙하고자 합니다. 관심 있으신 분은 이메일로 이력서를 보내주시기 바랍니다. (narrykim AT snu.ac.kr)

  

실험실 소식

    2008년 로레알-유네스코 여성과학자

    2007년 대표적 우수연구성과 50선

    2007년 선생님이 직접 쓰신 실험실 소개글

    2006년 BRIC 인터뷰 (1편, 2편)

    2005년 Quest 인터뷰

 

실험 방법

▪ In vitro analysis of pri-miRNA processing by the Drosha-DGCR8 complex (2007년 11월자)
▪ Northern blot analysis for microRNA (Nov 2007년 11월자)
▪ In vivo analysis of pri-miRNA processing by the Drosha-DGCR8 complex (2007년 11월자)

 

주요 논문

▪ Y. K. Kim and V. N. Kim (2007) "Processing of intronic microRNAs" EMBO J. 26(3):775-83    doi:10.1038/sj.emboj.7601512 (PDF)

▪ K. H. Yeom, Y. Lee, J. Han, M. R. Suh and V. N. Kim (2006) "Characterization of DGCR8/Pasha, the essential cofactor for Drosha in primary miRNA processing" Nucleic Acids Research 34(16):4622-9    doi:10.1093/nar/gkl458  (PDF, supplements)

▪ J. Han*, Y. Lee*, K. H. Yeom*, J. W. Nam, I. Heo, J. K. Rhee, S. Y. Sohn, Y. Cho, B. T. Zhang, and V. N. Kim (2006) "Molecular basis for the recognition of primary microRNAs by the Drosha-DGCR8 complex" Cell 125(5):887-901    doi:10.1016/j.cell.2006.03.043     (PDF, supplements)  *equal contribution

▪ Y. Lee*, I. Hur*, S. Y. Park*, Y. K. Kim, M. R. Suh and V. N. Kim(2006) "The role of PACT in the RNA silencing pathway" EMBO J. 25(3):522-32 doi:10.1038/sj.emboj.7600942    (PDF)  *equal contribution

▪ J. W. Nam, K. R. Shin, J. Han, Y. Lee, and V. N. Kim, B. T. Zhang (2005) "Human microRNA prediction through a probabilistic co-learning model of sequence and structure" Nucleic Acids Research 33(11):3570-81   doi:10.1093/nar/gki668    (PDF, supplements 1 2)

▪ J. Han*, Y. Lee*, K. H. Yeom, Y. K. Kim, H. Jin and V. N. Kim (2004) "The Drosha-DGCR8 complex in primary microRNA processing" Genes & Development 18(24):3016-27   doi:10.1101/gad.1262504  (PDF, supplements)   *equal contribution

▪ Y. Lee, M. Kim, J. Han, K. H. Yeom, S. Lee, S. H. Baek, and V. N. Kim (2004) "MicroRNA genes are transcribed by RNA polymerase II" EMBO J. 23(20):4051-60   doi:10.1038/sj.emboj.7600385   (PDF)

▪ M. R. Suh, Y. Lee, J. Y. Kim, S. K. Kim, S. H. Moon, J. Y. Lee, K. Y. Cha, H. M. Chung, H. S. Yoon, S. Y. Moon, V. N. Kim and K. S. Kim (2004) "Human embryonic stem cells express a unique set of microRNAs" Developmental Biology 270(2):488-98 doi:10.1016/j.ydbio.2004.02.019   (PDF)

▪ Y. Lee, C. Ahn, J. Han, H. Choi, J. Kim, J. Yim, J. Lee, P. Provost, O. Radmark, S. Kim, V. N. Kim (2003) "The nuclear RNase III Drosha initiates microRNA processing" Nature 425(6956):415-9   doi:10.1038/nature01957   (PDF, supplements)

▪ Y. Lee, K. Jeon, J. T. Lee, S. Kim and V. N. Kim (2002) "MicroRNA maturation: stepwise processing and subcellular localization" EMBO J. 21(17):4663-70   doi:10.1093/emboj/cdf476   (PDF)

 

REVIEW 논문

 ▪ V. N. Kim (2006) "Small RNAs just got bigger: Piwi-interacting RNAs (piRNAs) in mammalian testes" Genes & Developement 20(15):1993-7    doi:10.1101/gad.1456106    (PDF)

 ▪ V. N. Kim and J. W. Nam (2006) "Genomics of microRNA" Trends in Genetics 22(3):165-73   doi:10.1016/j.tig.2006.01.003   (PDF)

 ▪ V. N. Kim (2005) "MicroRNA biogenesis: coordinated cropping and dicing" Nature Reviews. Molecular Cell Biology 6(5):376-85   doi:10.1038/nrm1644   (PDF)